Tras consagrarse campeón en Italia y en la previa de la Copa del Mundo por Equipos, el cordobés alcanzó las semifinales del Abierto de Japón 2018, Torneo ITF Super Series, donde cayó 2-1 (7-5, 5-7 y 6-1) ante el local Shingo Kunieda.
Previamente, Fernández había derrotado por doble 6-0 al malayo Abu Samah Borhan, en octavos de final, y 7-5 y 6-1 al belga Joachim Gerard, en cuartos.
En el dobles, el N°2 del ranking mundial hizo dupla con el mismo Kunieda, con quien fueron subcampeones, tras caer en la final por 7-6 y 6-4 ante los británicos Gordon Reid y Alfie Hewett. Previamente, habían vencido 6-0 y 6-1 a los malayos Borham-Ariffin, en primera ronda, 6-4 y 6-1 a Weeks (Australia)-Sanada (Japón), en cuartos de final, y 7-5 y 6-2 a los holandeses Scheffers-Edgberink, en semis.
Tras un breve descanso, del 28 de mayo al 3 de junio Gustavo disputará junto a Agustín Ledesma y Ezequiel Casco la Copa del Mundo por Equipos BNP Páribas 2018 en Appeldorn, Holanda.